Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEMA3GQ9NS98 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms