Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FZD3Q9NPG1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FZD3Q9NPG1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms