Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TDRD3Q9H7E2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms