Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLIRPQ9GZT3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLIRPQ9GZT3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms