Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLHL4Q9C0H6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLHL4Q9C0H6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms