Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CEP44Q9C0F1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms