Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHACTR1Q9C0D0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHACTR1Q9C0D0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms