Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GSDMCQ9BYG8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms