Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAB11FIP5Q9BXF6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms