Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
IFT27Q9BW83 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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