Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RIOK2Q9BVS4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms