Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
POLR3CQ9BUI4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
POLR3CQ9BUI4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms