Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDC1Q9BTX1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDC1Q9BTX1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms