Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE5

AGMAT, Agmatinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGMATQ9BSE5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.02■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.02■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.02■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AGMATQ9BSE5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms