Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM79Q9BSE2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM79Q9BSE2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms