Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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GINS3Q9BRX5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
GINS3Q9BRX5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
GINS3Q9BRX5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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