Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SEMA3CQ99985 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SEMA3CQ99985 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms