Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms