Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPS6KC1Q96S38 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms