Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCNX1Q96RV3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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