Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRAM1Q96QH2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms