Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC85AQ96PX6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms