Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GPR78Q96P69 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms