Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CMTM3Q96MX0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms