Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SAMD8Q96LT4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms