Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms