Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDK5RAP3Q96JB5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDK5RAP3Q96JB5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
CDK5RAP3Q96JB5 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CDK5RAP3Q96JB5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms