Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCC11Q96J66 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms