Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZBED3Q96IU2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZBED3Q96IU2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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