Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

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Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
BCANQ96GW7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCANQ96GW7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
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