Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCARF2Q96GP6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SCARF2Q96GP6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms