Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL1Q96FI4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms