Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SGF29Q96ES7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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