Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RFT1Q96AA3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RFT1Q96AA3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms