Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A3Q8NEV1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A3Q8NEV1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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