Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC9Q8NEP7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHDC9Q8NEP7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHDC9Q8NEP7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHDC9Q8NEP7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC9Q8NEP7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC9Q8NEP7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC9Q8NEP7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC9Q8NEP7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms