Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC112Q8NEF3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC112Q8NEF3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms