Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPFIBP2Q8ND30 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms