Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HJURPQ8NCD3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms