Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCSAMQ8N6F7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSAMQ8N6F7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSAMQ8N6F7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSAMQ8N6F7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSAMQ8N6F7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSAMQ8N6F7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSAMQ8N6F7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSAMQ8N6F7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSAMQ8N6F7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSAMQ8N6F7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSAMQ8N6F7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSAMQ8N6F7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSAMQ8N6F7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSAMQ8N6F7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSAMQ8N6F7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSAMQ8N6F7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSAMQ8N6F7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSAMQ8N6F7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GCSAMQ8N6F7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms