Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SFRP1Q8N474 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SFRP1Q8N474 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms