Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RAB11FIP4Q86YS3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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RAB11FIP4Q86YS3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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RAB11FIP4Q86YS3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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RAB11FIP4Q86YS3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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RAB11FIP4Q86YS3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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RAB11FIP4Q86YS3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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RAB11FIP4Q86YS3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB11FIP4Q86YS3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
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