Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NLRP13Q86W25 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP13Q86W25 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms