Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SYDE1Q6ZW31 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms