Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC141Q6ZP82 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC141Q6ZP82 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms