Protein–RNA interactions for Protein: Q6X9E4

FBXW12, F-box/WD repeat-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW12Q6X9E4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FBXW12Q6X9E4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms