Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ABRAXAS1Q6UWZ7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABRAXAS1Q6UWZ7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms