Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRT80Q6KB66 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms