Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
INTS3Q68E01 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
INTS3Q68E01 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms