Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CLQ60I27 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CLQ60I27 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CLQ60I27 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CLQ60I27 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CLQ60I27 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CLQ60I27 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CLQ60I27 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CLQ60I27 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CLQ60I27 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CLQ60I27 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CLQ60I27 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CLQ60I27 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CLQ60I27 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CLQ60I27 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CLQ60I27 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CLQ60I27 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CLQ60I27 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CLQ60I27 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CLQ60I27 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CLQ60I27 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CLQ60I27 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ALS2CLQ60I27 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ALS2CLQ60I27 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms